הוועדה המחוזית לתכנון ולבנייה דרום אישרה תוכנית מפורטת לישוב חדש ניצנה. זאת, בהמשך לשתי החלטות ממשלה על הקמת היישוב החדש שהתקבלו ביולי 2001 בדבר "הקמת ישובים חדשים באזור חולות חלוצה בנגב", והשנייה ממרץ 2022.

היישוב ניצנה שמקודם על ידי רשות מקרקעי ישראל ומינהל התכנון, מוצע בתחום המועצה האזורית רמת הנגב, כ-70 ק"מ דרומית לבאר שבע, בסמוך לקו הגבול עם מצרים, ובמרחק אווירי של כ-50 ק"מ מרצועת עזה. כפר הנוער הקיים ניצנה "הקהילה החינוכית-התיישבותית ניצנה על שם אריה לובה אליאב", שהוקם במקום ב-1986 על ידי לובה אליאב ז"ל, יהיה חלק מהיישוב החדש.

תכנון היישוב נפרש על פני ארבעה אשכולות בינוי המופרדים על ידי מערך השטחים הפתוחים. בתוכנית ששטחה הכולל עומד על כ-3,000 דונם, מוצעים בתכנון מפורט 1,144 יחידות דיור בתמהיל בנייה מגוון הכולל צמודי קרקע, דירות גן ופנטהאוז, בנייה טורית ובנייה מדורגת לאורך הוואדי. כמו כן, התוכנית מקצה שטחים למבנים ומוסדות ציבור, מסחר, מוקדים הכוללים עירוב שימושים למסחר ותעסוקה, דיור מיוחד, אכסון תיירותי בהיקף של כ-200 חדרי מלון בסמוך לגן הלאומי ניצנה.

היקפי התעסוקה והמסחר נועדו לתת מענה לכלל הישובים במרחב זה, לקהילה החינוכית התיישבותית ניצנה ואף לבסיסים הקרובים ולמבקרים. כמו כן התוכנית כוללת שטחים לעוד כ-1,100 יחידות דיור, ושטחים לתעסוקה למימוש עתידי. כך, שבסופו של תהליך, עשוי היישוב לכלול כ-8,000-9,000 תושבים.

בשטח התוכנית שנערכה על ידי משרד אדריכלים "טומס מ.לייטרסדורף בע"מ", מצויים ערוצי נחלים בהם יש שרידי תשתית קדומה להולכת מים לצרכי חקלאות מהתקופה הביזנטית. התוכנית מציעה לשמר ולשחזר את הצמחייה בערוצים ולהותירם כשטחים ציבוריים פתוחים שיהוו חלק מנוף הישוב. וכן בתחום היישוב קיים פסל "נתיב השלום" של האומן דני קרוון. בתכנון היישוב מוצעת רצועה פתוחה סביב הפסל הכולל 100 עמודים עליהם כתובה המילה "שלום" בשפות שונות.

מנכ"ל מינהל התכנון, רפי אלמליח מסר כי "היישוב ניצנה יהווה מוקד משמעותי לביסוס ההתיישבות שבפתחת ניצנה, בה מצויים כיום היישובים באר מילכה, קדש ברנע, כמהין ועזוז. היישוב ישמש גם כמוקד שירותים אזורי, ובצמוד לקריה החינוכית ולתיירות מדברית, ישלים את הראייה הכוללות של החלוציות. דווקא בזמנים אלה, אנו מבינים את החשיבות בהקמת עוגן ליישובים קטנים שייתן ביטחון לתושבי האזור".